192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1357 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 76 aa  152  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 76 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  34.78 
 
 		 87 aa  50.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  34.78 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  36.67 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  38.71 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  34.92 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1374  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.717323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  38.24 
 
 		 305 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1184  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410956  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0858  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.949499  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  36.36 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.41 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  37.5 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 83 aa  47.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1649  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0554  prophage LambdaSa1, Cro/CI family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 63 aa  47.4  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  42.62 
 
 		 192 aa  47  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 256 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0098  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  36.76 
 
 		 305 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  39.06 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 252 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4570  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.27714 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15700  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  33.9 
 
 		 507 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.645755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4657  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  38.24 
 
 		 305 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0810  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0185254  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  36.07 
 
 		 517 aa  44.7  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2543  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0592097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 528 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0890  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 230 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  38.18 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  35.94 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  31.25 
 
 		 309 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0877  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  38.24 
 
 		 317 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3773  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  34.33 
 
 		 294 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1266  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.119071 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.808324 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>