58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0669 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 383 aa  769    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.31 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  37.47 
 
 		 400 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  32.91 
 
 		 411 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  35.7 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  35.24 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  32.02 
 
 		 407 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 		 410 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  31 
 
 		 524 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  32.67 
 
 		 399 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 409 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 404 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  29.24 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  27.48 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 401 aa  89.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.71 
 
 		 406 aa  89.4  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  29.88 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  28.21 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  34.98 
 
 		 491 aa  87  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  30.08 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  27.65 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  31.07 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  30.71 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  28.62 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  28.29 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  27.65 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  23.99 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  32.24 
 
 		 527 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  26.5 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  26.42 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  29.96 
 
 		 535 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  27.82 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  28.64 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  27.46 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  25.27 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  26.62 
 
 		 399 aa  46.6  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  25.93 
 
 		 397 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0894  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 215 aa  45.1  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03080  hypothetical protein  34.46 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1046  putative DNA-binding protein  37.18 
 
 		 87 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.32421  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1118  putative transcriptional regulator  39.34 
 
 		 213 aa  43.1  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 152 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 186 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 186 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 186 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 186 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>