53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0840 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  90.3 
 
 		 402 aa  724    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 402 aa  790    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  35.61 
 
 		 405 aa  186  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.56 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  37.66 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  35.4 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  30.85 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  30.59 
 
 		 411 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  28.61 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  29.57 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 524 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  28.76 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  26.75 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  26.8 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  27.65 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.25 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  26.23 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  29.12 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  26.12 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  25.5 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  29.2 
 
 		 562 aa  59.7  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  28.04 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  29.05 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  27.12 
 
 		 445 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  27.03 
 
 		 470 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  27.72 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  26.44 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  25.08 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2727  DNA-binding transcriptional regulator  38.03 
 
 		 208 aa  47  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118237 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  39.13 
 
 		 383 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  32.05 
 
 		 122 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 208 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 77 aa  43.9  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  39.44 
 
 		 208 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 105 aa  43.5  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 83 aa  43.5  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 390 aa  43.1  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  26.42 
 
 		 399 aa  43.1  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  37.5 
 
 		 245 aa  43.1  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>