50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2579 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1112    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  69.21 
 
 		 445 aa  541  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  48.94 
 
 		 350 aa  252  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  42.76 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 410 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  32.54 
 
 		 407 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 524 aa  127  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  36.02 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.72 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  37.45 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  34.92 
 
 		 399 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 403 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  31.14 
 
 		 402 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 411 aa  100  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 404 aa  87  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  32.91 
 
 		 527 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  30.71 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  29.49 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  28.14 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0185  transcriptional regulator, XRE family  45.33 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  29.75 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  31.72 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4555  hypothetical protein  35.14 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3081  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 81 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.634194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3639  hypothetical protein  54.55 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  30.34 
 
 		 535 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4554  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  26.26 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  27.49 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  24.89 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  38.75 
 
 		 303 aa  57  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.78 
 
 		 406 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  29.2 
 
 		 402 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  30 
 
 		 397 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 409 aa  52  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 406 aa  51.6  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  27.8 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 403 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  47.27 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  30.73 
 
 		 382 aa  45.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 394 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 397 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 397 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>