More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0868 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  72.63 
 
 		 179 aa  261  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  71.51 
 
 		 179 aa  259  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  67.22 
 
 		 180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  68.33 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 186 aa  166  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 184 aa  158  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  44.13 
 
 		 184 aa  148  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  39.11 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 202 aa  97.1  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  40.74 
 
 		 457 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  32.79 
 
 		 897 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  38.89 
 
 		 457 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  30.46 
 
 		 455 aa  61.6  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  36.7 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  35.51 
 
 		 454 aa  59.3  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  32.74 
 
 		 863 aa  59.3  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  28.78 
 
 		 877 aa  58.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  26.5 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 863 aa  57.8  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  26.57 
 
 		 863 aa  57  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.78 
 
 		 465 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  37.86 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  33.91 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2632  putative signal transduction protein with CBS domains  35.59 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  29.41 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0822  diguanylate cyclase  30 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  32.03 
 
 		 468 aa  55.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  31.39 
 
 		 845 aa  55.1  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  29.69 
 
 		 454 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  33.33 
 
 		 455 aa  54.7  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  33.62 
 
 		 455 aa  54.7  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  32.77 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  33.04 
 
 		 463 aa  54.3  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 873 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.66 
 
 		 476 aa  54.3  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  29.06 
 
 		 250 aa  53.9  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.86 
 
 		 479 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  25.71 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  28.81 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  34.62 
 
 		 277 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.25 
 
 		 453 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  27.43 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  31.72 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  26.72 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  29.03 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  27.59 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  29.41 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  30.63 
 
 		 879 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  32.74 
 
 		 862 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2357  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  32.74 
 
 		 435 aa  52.4  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.889148  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  30.63 
 
 		 879 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.01 
 
 		 487 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 		 139 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  27.22 
 
 		 331 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  33.59 
 
 		 458 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  30.08 
 
 		 258 aa  51.6  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.21 
 
 		 769 aa  51.6  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  29.03 
 
 		 230 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  32.2 
 
 		 281 aa  51.2  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  32.73 
 
 		 456 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  26.75 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  30.4 
 
 		 225 aa  51.2  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  27.12 
 
 		 141 aa  51.2  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3498  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.82 
 
 		 143 aa  51.2  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156756  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  30.07 
 
 		 247 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.88 
 
 		 496 aa  51.2  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  28.8 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30.07 
 
 		 246 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  25.21 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  25.86 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  31.09 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  31.48 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  27.27 
 
 		 453 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0521  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 290 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  26.5 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  31.3 
 
 		 462 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  27.68 
 
 		 688 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  30.51 
 
 		 337 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  30.25 
 
 		 880 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  28.12 
 
 		 464 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  27.91 
 
 		 460 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1886  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.77 
 
 		 485 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  29.2 
 
 		 875 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  31.78 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.86 
 
 		 605 aa  49.3  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  29.37 
 
 		 468 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.01 
 
 		 487 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  30.91 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>