125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5447 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 103 aa  210  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  49.44 
 
 		 93 aa  88.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  44.68 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2419  transcriptional regulator, XRE family  47.78 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  42.7 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  37.21 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4157  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.555179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  39.78 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  40.96 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  40.45 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  45.12 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  44.05 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  42.17 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  45.35 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  39.47 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  38.16 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  35.63 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  35.63 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  38.37 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  36.05 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  36.05 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2651  transcriptional regulator, XRE family  51.92 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2226  transcriptional regulator  50 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.782341  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  37.8 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  41.79 
 
 		 517 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 503 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  32.53 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  32.53 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  28.95 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 513 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  37.65 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1442  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4562  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2529  transcriptional regulator, XRE family  35.37 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000784971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0807  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 266 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  42.31 
 
 		 508 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3863  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  40 
 
 		 507 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.640494  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  38.89 
 
 		 516 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0010  DNA-binding protein  31.76 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.235299  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  44.26 
 
 		 465 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1722  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  28.77 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  38.6 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  38.6 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>