222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2743 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 180 aa  351  2.9999999999999997e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  77.22 
 
 		 180 aa  274  5e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  68.33 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  63.33 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  62.22 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 202 aa  104  6e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  35.96 
 
 		 873 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  29.57 
 
 		 875 aa  61.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  28.7 
 
 		 875 aa  61.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  25.84 
 
 		 368 aa  58.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  28.68 
 
 		 877 aa  58.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  26.56 
 
 		 865 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  31.58 
 
 		 769 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  24.41 
 
 		 907 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  34.17 
 
 		 867 aa  55.8  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.58 
 
 		 873 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  27.59 
 
 		 880 aa  54.7  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  27.46 
 
 		 875 aa  54.7  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  31.67 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  26.77 
 
 		 279 aa  52.4  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  52 
 
 		 119 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  22.48 
 
 		 885 aa  52.8  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 		 99 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  23.08 
 
 		 863 aa  51.6  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  27.2 
 
 		 890 aa  51.6  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  32.84 
 
 		 291 aa  51.6  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  23.78 
 
 		 863 aa  51.6  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  32.61 
 
 		 688 aa  50.8  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  26.05 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  33.04 
 
 		 845 aa  50.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.44 
 
 		 877 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 99 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  31.3 
 
 		 479 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  25.44 
 
 		 880 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  24.35 
 
 		 883 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  28.07 
 
 		 904 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  52.08 
 
 		 112 aa  49.3  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  32.61 
 
 		 688 aa  49.3  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  27.74 
 
 		 874 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  27.45 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  31.53 
 
 		 292 aa  48.9  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  28.38 
 
 		 872 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  29.77 
 
 		 463 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  26.77 
 
 		 282 aa  48.5  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  23.24 
 
 		 881 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  32.23 
 
 		 309 aa  48.5  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  27.08 
 
 		 909 aa  48.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.83 
 
 		 479 aa  48.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 91 aa  48.1  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  28 
 
 		 225 aa  48.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  26.83 
 
 		 277 aa  48.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  24.59 
 
 		 250 aa  47.8  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 		 688 aa  47.8  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  28.7 
 
 		 337 aa  47.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  26.4 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.85 
 
 		 482 aa  47  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  24.49 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.36 
 
 		 465 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  27.5 
 
 		 258 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  25.64 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  28.12 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  25 
 
 		 880 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.58 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  30.97 
 
 		 904 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  29.71 
 
 		 454 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  30 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  34.51 
 
 		 463 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  24.58 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2632  putative signal transduction protein with CBS domains  35.65 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  22.86 
 
 		 313 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  25.44 
 
 		 880 aa  45.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  26.56 
 
 		 279 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 528 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  28.86 
 
 		 455 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.14 
 
 		 230 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  50 
 
 		 465 aa  45.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  52.08 
 
 		 115 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  30.33 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 		 136 aa  45.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  32.95 
 
 		 453 aa  45.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  27.64 
 
 		 214 aa  45.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.61 
 
 		 888 aa  45.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  27.87 
 
 		 221 aa  45.1  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 102 aa  45.1  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 256 aa  45.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  27.68 
 
 		 888 aa  45.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  40.26 
 
 		 108 aa  45.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  29.89 
 
 		 373 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>