78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3701 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 101 aa  206  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4813  putative transcriptionl regulator HipB  85.15 
 
 		 101 aa  156  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 161 aa  97.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  62.69 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  61.43 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  62.69 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  61.43 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1365  XRE family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 173 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  64.18 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  64.18 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  64.18 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  64.18 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  64.18 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  64.18 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5530  XRE family transcriptional regulator  62.69 
 
 		 162 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0171722 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  58.21 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  56.06 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  45.45 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0338  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3946  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.37 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  40.68 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  30.95 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 87 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  45.1 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1266  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.119071 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  38.33 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  38.33 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0010  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.235299  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  36.84 
 
 		 84 aa  42.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 513 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  38.78 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3418  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  36.84 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 147 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3339  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 733 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 73 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1635  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3478  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.2 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 208 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 208 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4574  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 208 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  30.77 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  28.3 
 
 		 94 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  34 
 
 		 176 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2734  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 108 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>