45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3946 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3946  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  100 
 
 		 91 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  62.5 
 
 		 85 aa  90.1  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5270  putative XRE family transcriptional regulator  67.35 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5916  XRE family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  41.1 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  41.79 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4813  putative transcriptionl regulator HipB  42.37 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  40.68 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4902  transcriptional regulator, XRE family  46.48 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.173853  normal  0.0865423 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  40.68 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  40.68 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  40.68 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  40.68 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1365  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 173 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  40.68 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3754  helix-turn-helix domain protein  48 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  34.57 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  40.68 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0338  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5530  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0171722 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 825 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  35.62 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  36.67 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  36.67 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  29.17 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  30.88 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1279  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 380 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>