57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0378 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 93 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 93 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  98.92 
 
 		 93 aa  186  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  94.62 
 
 		 93 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  80.65 
 
 		 93 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  72.82 
 
 		 103 aa  143  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  67.39 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  64.52 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  65.59 
 
 		 83 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 82 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  45 
 
 		 83 aa  72  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  44.78 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  39.24 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  39.24 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  39.24 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  39.24 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  39.24 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  44.07 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  44.07 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  44.07 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  44.07 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  44.07 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  44.07 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  40.68 
 
 		 155 aa  50.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  36.92 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 85 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5530  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0171722 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1365  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2442  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5916  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3946  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.67 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  30.77 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001517  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000562754  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  40.35 
 
 		 517 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0807  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4813  putative transcriptionl regulator HipB  29.85 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  47.46 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>