50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4902 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4902  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 84 aa  164  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.173853  normal  0.0865423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3946  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.48 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  39.76 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  41.54 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5916  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 380 aa  50.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.93 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.93 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  33.71 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3754  helix-turn-helix domain protein  48.53 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  31.76 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  31.76 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  31.76 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5270  putative XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  32.91 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 187 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  39.71 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 247 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  36.36 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  36.36 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  34.85 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  34.85 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 83 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 135 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 825 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  34.85 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 135 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  34.85 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  34.85 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  34.85 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  52.78 
 
 		 368 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4813  putative transcriptionl regulator HipB  29.73 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0557  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  25.29 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  25.29 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>