62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1915 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 80 aa  164  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  48 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  41.56 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  40.79 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  39.08 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  39.08 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  36.78 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  40 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  40 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  40 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  40 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  40 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  41.54 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  39.44 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  37.33 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  40 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  38.96 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  42.19 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  34.83 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4813  putative transcriptionl regulator HipB  35.71 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  39.71 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  28.95 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  28.95 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  28.95 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  28.95 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  28.95 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  28.95 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1365  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5530  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0171722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0478  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5916  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  36.92 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4902  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.173853  normal  0.0865423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3102  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 247 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0520  hypothetical protein  39.34 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5270  putative XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 101 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>