40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0567 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  169  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  49.4 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  45.24 
 
 		 84 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  50.63 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  49.32 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  45.16 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  48.31 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  48.31 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  43.01 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  48.19 
 
 		 79 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 93 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  40.96 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  45.45 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  40 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  40.48 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  40.48 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  40.48 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  40.48 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  43.94 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2442  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  39.39 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  39.39 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  39.39 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  43.64 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  43.64 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  43.64 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  41.82 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001517  predicted transcriptional regulator  33.82 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000562754  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5916  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 175 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3808  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0020912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>