73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1462 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  211  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 100 aa  62  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  33.33 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  33.7 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  33.7 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  30.95 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  31.33 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  30.95 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  25.88 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  28.26 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  34.57 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  28.38 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  27.91 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  32.86 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  29.21 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  26.19 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  26.19 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  28.99 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4562  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  27.17 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 459 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  43.64 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  40.43 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2954  putative addiction module antidote protein  30.16 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.331148  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  35.29 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  25.32 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  48.84 
 
 		 142 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 134 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 91 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 189 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  28.09 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1274  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 212 aa  41.2  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 259 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  26.76 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4157  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.555179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  26.03 
 
 		 210 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 95 aa  40  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3281  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 173 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.871806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 173 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>