34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3808 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3808  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 80 aa  158  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0020912  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  73.08 
 
 		 79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0820  transcriptional regulator, XRE family  67.95 
 
 		 79 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2047  transcriptional regulator, XRE family  46.05 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5619  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173792  normal  0.0387834 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5240  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1274  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.329441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0204  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4031  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.858841 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5431  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 110 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716387  normal  0.867638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1931  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5916  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5848  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 176 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3385  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  39.47 
 
 		 508 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3102  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 513 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0072  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43580  DNA binding protein, XRE-like protein  39.68 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.485824  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0883  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0718  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.764173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  38.18 
 
 		 270 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05270  predicted transcriptional regulator  55.56 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  51.35 
 
 		 237 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  51.35 
 
 		 237 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 		 279 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 410 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>