23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1274 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1274  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.329441  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2047  transcriptional regulator, XRE family  59.04 
 
 		 83 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3808  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0020912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0820  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102782 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5240  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5619  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173792  normal  0.0387834 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5431  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716387  normal  0.867638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0204  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3385  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0718  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.764173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43580  DNA binding protein, XRE-like protein  45.16 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.485824  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5848  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0072  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08690  Helix-turn-helix protein  38.33 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176489 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3102  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4637  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4031  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 88 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.858841 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5916  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  38.24 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1356  helix-turn-helix domain-containing protein  39.53 
 
 		 321 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00217094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>