39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0204 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0204  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  167  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43580  DNA binding protein, XRE-like protein  64.62 
 
 		 85 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.485824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0820  transcriptional regulator, XRE family  46.84 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2047  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3808  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0020912  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1274  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.329441  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1298  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3385  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1618  putative DNA-binding protein  34.72 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5431  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716387  normal  0.867638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5240  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5619  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173792  normal  0.0387834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 407 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0718  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.764173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3102  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 87 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  37.93 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 182 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 178 aa  41.6  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  39.39 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4031  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.858841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  44.9 
 
 		 199 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.9 
 
 		 199 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  44.9 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  36.21 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  36.21 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 244 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 182 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 182 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>