102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1298 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1298  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 86 aa  179  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0204  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0718  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.764173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5088  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3385  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43580  DNA binding protein, XRE-like protein  43.14 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.485824  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5036  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  73.08 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  73.08 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  52.63 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  35.71 
 
 		 264 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 406 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  73.08 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  73.08 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 201 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  73.08 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  52.78 
 
 		 368 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 203 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1824  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2047  transcriptional regulator, XRE family  27.94 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3102  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  69.23 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  69.23 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  69.23 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  35.85 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 213 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0883  XRE family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1353  XRE family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000308869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  31.25 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1274  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  47.92 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  31.82 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5240  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5619  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173792  normal  0.0387834 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  37.93 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1577  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 361 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  38 
 
 		 323 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6814  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0149  molybdate-binding domain-containing protein  53.12 
 
 		 349 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0290887  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1931  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 88 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 209 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0717  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 96 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4798  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 222 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 208 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  30.34 
 
 		 122 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 287 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 201 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  30 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.06 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3863  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  35.71 
 
 		 507 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.640494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0936  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  30 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  30 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 328 aa  41.6  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 401 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.36 
 
 		 284 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  30 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  36.59 
 
 		 509 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  37.7 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1430  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 259 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776927 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  28.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5258  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1274  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.329441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2262  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  28.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  28.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  28.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  28.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 176 aa  40.4  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  41.07 
 
 		 283 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2292  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00214116  hitchhiker  0.0019025 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  36.21 
 
 		 175 aa  40.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5848  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  48.57 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 83 aa  40  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2461  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 79 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000100603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 368 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>