49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1577 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1577  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 119 aa  242  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0936  helix-turn-helix domain-containing protein  89.08 
 
 		 119 aa  220  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4828  XRE family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  34 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 401 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  42.53 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  33.82 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  40 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  25.83 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  25.83 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  25.83 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 60 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  30.91 
 
 		 107 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 83 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 225 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1224  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1627  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0696983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  30.91 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  24.78 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  32.76 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 200 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 245 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  23.08 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  32.84 
 
 		 410 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  30.91 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  30.91 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  30.91 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  30.91 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 397 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 76 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 197 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  37.7 
 
 		 472 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>