69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0936 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0936  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 119 aa  241  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1577  XRE family transcriptional regulator  89.08 
 
 		 119 aa  220  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4828  XRE family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 123 aa  130  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  43.18 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  34.33 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  33.82 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  39.34 
 
 		 472 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  29.31 
 
 		 369 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  32.73 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  32.73 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  31.82 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  32.73 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 123 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  23.89 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  23.89 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 245 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  30.43 
 
 		 184 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  23.89 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 364 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  23.76 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  31.82 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  32.76 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 230 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  32.73 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  32.84 
 
 		 410 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1224  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1627  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0696983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  31.82 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 397 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 368 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 200 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  36.67 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 210 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 505 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  32.58 
 
 		 374 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 78 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  45.95 
 
 		 469 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  23.89 
 
 		 186 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  32.93 
 
 		 374 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35 
 
 		 481 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1934  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 179 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 203 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>