30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0717 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0717  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01700  Helix-turn-helix protein  36.67 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.935014  normal  0.201437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 490 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 490 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 503 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 504 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0972  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 228 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.36 
 
 		 481 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 397 aa  42  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 488 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  36.92 
 
 		 489 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 478 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2002  putative transcriptional regulator, Nlp  40.82 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1176  putative transcriptional regulator, Nlp  40.82 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.035714  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 397 aa  42  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 209 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 489 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0622  transcriptional regulator, putative  34.92 
 
 		 303 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.436499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 474 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  39.62 
 
 		 227 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  47.62 
 
 		 270 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 211 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 513 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  29.33 
 
 		 200 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 104 aa  40  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 433 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  59.46 
 
 		 278 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>