49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43580 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_43580  DNA binding protein, XRE-like protein  100 
 
 		 85 aa  166  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.485824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0204  XRE family transcriptional regulator  60.49 
 
 		 82 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2047  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0820  transcriptional regulator, XRE family  45.07 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102782 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1274  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.329441  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3808  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0020912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 407 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  40.35 
 
 		 235 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5619  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173792  normal  0.0387834 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5240  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1298  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  51.22 
 
 		 469 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 414 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3385  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5431  transcriptional regulator, XRE family  35.44 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716387  normal  0.867638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0772  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 244 aa  43.9  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 205 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0718  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.764173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5088  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5036  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1462  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  42.11 
 
 		 178 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 187 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0883  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  51.35 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03640  predicted transcriptional regulator  37.7 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2262  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  48.72 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  48.72 
 
 		 198 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  38.6 
 
 		 352 aa  40.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1858  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3774  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0502189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0415  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187389  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  40.35 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 380 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>