44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3687 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 79 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3808  XRE family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 80 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0020912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0820  transcriptional regulator, XRE family  64.1 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2047  transcriptional regulator, XRE family  48.53 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0204  XRE family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5619  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173792  normal  0.0387834 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5240  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5431  transcriptional regulator, XRE family  39.19 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716387  normal  0.867638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1274  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.329441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43580  DNA binding protein, XRE-like protein  42.19 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.485824  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 279 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4031  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.858841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 227 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0972  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 228 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3102  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  41.82 
 
 		 235 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20520  DNA binding protein, XRE family  36.11 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 513 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  41.79 
 
 		 508 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1931  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6814  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5258  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  41.79 
 
 		 465 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  43.59 
 
 		 421 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  43.59 
 
 		 421 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0415  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3385  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 169 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2461  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000100603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 252 aa  40.8  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 503 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5848  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0549  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  36.67 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  39.29 
 
 		 467 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 737 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 101 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>