65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2300 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2300  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 83 aa  164  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4676  normal  0.0781395 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2442  XRE family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  40.96 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  42.03 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  43.08 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  38.67 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 206 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  38.46 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  34.62 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  39.68 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  33.78 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  48.28 
 
 		 508 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  40.62 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1757  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.489894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  33.78 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  33.78 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  33.78 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2883  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  33.78 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001517  predicted transcriptional regulator  39.68 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000562754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.1 
 
 		 284 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0549  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  33.87 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  37.29 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04053  Transcriptional Regulator, XRE family protein  33.82 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  43.1 
 
 		 517 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  35.59 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3755  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  36.51 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 281 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  42.62 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 189 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  42.25 
 
 		 509 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 84 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 192 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 85 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2047  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 138 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4574  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  37.29 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  39.34 
 
 		 155 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>