More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0821 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0821  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
70 aa  140  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.323494  hitchhiker  0.000184498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  68.12 
 
 
69 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  42.65 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 
66 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  46.15 
 
 
377 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  41.18 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 
68 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  45.31 
 
 
73 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  45.31 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  45.16 
 
 
79 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  45.16 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05270  predicted transcriptional regulator  50 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  45.31 
 
 
73 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  45.31 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  45.31 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 
83 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  45.31 
 
 
73 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  45.31 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  44.78 
 
 
377 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  46.77 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  42.86 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  42.03 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  46.03 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  45.16 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2913  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  46.88 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  44.62 
 
 
377 aa  62  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  42.19 
 
 
66 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  42.19 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  42.19 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  42.19 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  42.19 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  42.19 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  44.44 
 
 
72 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  45.16 
 
 
67 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 
67 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
72 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 
70 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
72 aa  60.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2164  transcriptional regulator, XRE family  49.23 
 
 
75 aa  60.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27184  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 
68 aa  60.5  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
73 aa  60.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
70 aa  60.1  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  42.86 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  42.86 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  42.86 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  42.86 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  42.86 
 
 
376 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  42.86 
 
 
72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  36.92 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  42.86 
 
 
72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  42.86 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  41.27 
 
 
72 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  39.68 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  40.62 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5575  DNA-binding protein  42.37 
 
 
63 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
63 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  38.1 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  38.1 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  41.27 
 
 
68 aa  57.8  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  45 
 
 
64 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  40 
 
 
69 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 
65 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  38.46 
 
 
69 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
224 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4938  transcriptional regulator, DNA-binding protein  42.37 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  39.06 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
63 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  44.07 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.555038 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
69 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
63 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  44.26 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12593  repressor protein  41.27 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
70 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0430  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 
69 aa  55.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1128  Cro/CI family transcriptional regulator  40.68 
 
 
65 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000913081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5107  DNA-binding protein  42.37 
 
 
63 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  40.62 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4953  transcriptional regulator, DNA-binding protein  42.37 
 
 
63 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282305  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  40.62 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5498  DNA-binding protein  42.37 
 
 
63 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  43.33 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  40.62 
 
 
101 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>