53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0665 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 100 aa  203  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  63.27 
 
 		 100 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  67 
 
 		 100 aa  140  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2672  XRE family transcriptional regulator  52 
 
 		 100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474837  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  44.9 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  44.9 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 100 aa  97.8  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  41 
 
 		 100 aa  94.7  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1380  transcription regulator  38 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  34.15 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  50.85 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  46.67 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 264 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 264 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  31.18 
 
 		 103 aa  52  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  39.13 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5283  hypothetical protein  36.36 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  38.89 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1858  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  38.89 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  43.18 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  35.16 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  43.08 
 
 		 227 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1480  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.86 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.695506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 266 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 114 aa  42  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4226  hypothetical protein  29 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3583  hypothetical protein  29 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  31.58 
 
 		 94 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  31.58 
 
 		 94 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 361 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  37.25 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 91 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 115 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>