42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0895 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  221  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  50.54 
 
 		 100 aa  97.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  48.91 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  45.26 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  43.27 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  39.05 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  43.02 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  48.39 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5283  hypothetical protein  41.25 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  39.71 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  43.33 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  39.71 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 103 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1380  transcription regulator  32.95 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1480  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.17 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.695506 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 264 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 264 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  33.66 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  36.71 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 263 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  32.91 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  32.91 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  36.76 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2672  XRE family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474837  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  28.12 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3102  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1931  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>