40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12056 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  100 
 
 		 101 aa  201  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  41.05 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13205  transcriptional regulator  42.99 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000994764  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  40.23 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  46.77 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5820  XRE family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4345  transcriptional regulator, XRE family  39.51 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0197394  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  36.19 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8306  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0390  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  37.23 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  42.62 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  41.54 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  35.82 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 100 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  35.8 
 
 		 225 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  35.8 
 
 		 225 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  40.32 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1380  transcription regulator  28.74 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 218 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  36.96 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  47.46 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  47.46 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  47.46 
 
 		 93 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 		 114 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>