35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8556 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8306  transcriptional regulator, XRE family  49.5 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  63.93 
 
 		 109 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0390  XRE family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  41.12 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5820  XRE family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  42.16 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  42.16 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  56.45 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4345  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0197394  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13205  transcriptional regulator  41.07 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000994764  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  40.23 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  35.78 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  38.89 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  52.46 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  36.46 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  43.94 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 123 aa  48.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  45.07 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  45.07 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  39.02 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  47.27 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  47.27 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  39.34 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  46.48 
 
 		 187 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  40.82 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  40.98 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  41.67 
 
 		 194 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 210 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>