42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1480 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1480  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  100 
 
 		 92 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.695506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  56.25 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  46.88 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  48.33 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  46.55 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  42.19 
 
 		 103 aa  60.1  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  43.66 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  46.03 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5283  hypothetical protein  47.54 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  43.86 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 263 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 264 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 264 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  37.66 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13205  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000994764  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  40.54 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  38.3 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1380  transcription regulator  35.59 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2672  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  29.73 
 
 		 124 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  38.6 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3278  hypothetical protein  46 
 
 		 110 aa  41.2  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.397996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  34.15 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  41.03 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4345  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0197394  normal  0.880673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>