29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5283 on replicon NC_011882
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011882  Cyan7425_5283  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  260  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  50.94 
 
 		 114 aa  102  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  50 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  41.03 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  46.91 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  41.25 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  44.16 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  37 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1480  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  51.02 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.695506 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1380  transcription regulator  32.95 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  43.48 
 
 		 103 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  43.48 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 263 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  39.47 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  34.09 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02632  helix-turn-helix domain protein  33.85 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2672  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474837  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 100 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>