31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1324 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1324  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 85 aa  168  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 85 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  41.56 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  38.96 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  47.83 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  50 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  35 
 
 		 84 aa  50.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5908  helix-turn-helix domain protein  34.57 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2018  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97795  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 73 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>