36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4916 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.05 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  52 
 
 		 80 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  43.42 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  45.83 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  41.33 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  42.67 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  45.95 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  38.67 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  38.67 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  38.67 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03892  DNA-binding protein  39.74 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  37.33 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  37.33 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  37.33 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1324  helix-turn-helix domain-containing protein  36.71 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4563  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1926  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.616703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2018  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97795  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1035  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0970  hypothetical protein  45.24 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>