37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1035 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1035  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 159 aa  323  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28910  Helix-turn-helix protein  56.58 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 89 aa  51.2  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2399  helix-turn-helix domain protein  25.17 
 
 		 184 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3148  transcriptional regulator, XRE family  26 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  43.48 
 
 		 316 aa  47.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  43.48 
 
 		 309 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2559  XRE family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  36.67 
 
 		 312 aa  44.7  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.56 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1303  XRE family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0137454 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4281  transcriptional regulator, XRE family  25.17 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5247  transcriptional regulator, XRE family  25.87 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.819669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3268  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3138  helix-turn-helix domain protein  31.88 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0455565  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  44.44 
 
 		 323 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1697  XRE family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.312098  hitchhiker  0.00643035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15530  Helix-turn-helix protein  25.87 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.767389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  34.44 
 
 		 127 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3007  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 164 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1350  XRE family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316988 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4238  XRE family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0673449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4910  transcriptional regulator, XRE family  29.77 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3078  XRE family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 120 aa  41.2  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 81 aa  41.2  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  36.14 
 
 		 119 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 119 aa  40.8  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 85 aa  40.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 122 aa  40.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1052  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.41 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0559159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>