48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3281 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3281  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 173 aa  350  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.871806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  94.22 
 
 		 173 aa  317  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  40.85 
 
 		 102 aa  51.2  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2651  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 112 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 79 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 101 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  31.68 
 
 		 217 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  31.68 
 
 		 217 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  31.68 
 
 		 217 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  32.86 
 
 		 80 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  32.86 
 
 		 80 aa  44.7  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  32.86 
 
 		 80 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2143  helix-turn-helix domain protein  42.59 
 
 		 82 aa  44.7  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  32.86 
 
 		 80 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  32.86 
 
 		 80 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  32.86 
 
 		 80 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 497 aa  44.3  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 104 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 104 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 104 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 91 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  32.94 
 
 		 91 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1274  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  36.07 
 
 		 94 aa  43.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 68 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 407 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  31.15 
 
 		 94 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 88 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 76 aa  42.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 503 aa  42  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2712  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 103 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1462  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 114 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 76 aa  41.6  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 114 aa  41.6  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 209 aa  41.6  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  34.15 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  37.25 
 
 		 90 aa  41.6  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 110 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 80 aa  41.2  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3926  transcriptional regulator, XRE family  30.34 
 
 		 127 aa  40.8  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 89 aa  40.8  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01955  hypothetical protein  43.18 
 
 		 88 aa  40.8  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 76 aa  40.8  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  29.17 
 
 		 99 aa  40.8  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  29.17 
 
 		 99 aa  40.8  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>