81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0513 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 70 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  56.92 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 73 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3466  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 321 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  38.71 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  38.71 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  38.71 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0450  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 268 aa  47  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2248  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1626  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  35 
 
 		 184 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  35.09 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  32.31 
 
 		 301 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 115 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 131 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 111 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 144 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  27.87 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  32.81 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  32.81 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  32.81 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  32.81 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  32.81 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2624  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00551798  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1968  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 257 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  32.81 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  29.82 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 183 aa  40.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6072  putative transcriptional regulator Cro/CI family  41.18 
 
 		 233 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0378  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309443  hitchhiker  0.00198984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 194 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  32.81 
 
 		 125 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  32.81 
 
 		 125 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 114 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 113 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>