152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0309 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0309  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  219  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.793931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0316  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 107 aa  219  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1025  XRE family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1044  helix-turn-helix domain-containing protein  54.9 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0449357  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  43.08 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  43.08 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 359 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 223 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 321 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  38.46 
 
 		 229 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 191 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 202 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 223 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 199 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 197 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 200 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 205 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 528 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3082  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  34.15 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 183 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  30.86 
 
 		 201 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  37.63 
 
 		 488 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 192 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0364  phage repressor  33.66 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 190 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 196 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  29.03 
 
 		 233 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0928  Cro/CI family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00442924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0858  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 243 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.949499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 201 aa  43.5  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  24.76 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 490 aa  43.5  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 201 aa  43.5  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  31.25 
 
 		 301 aa  43.5  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1266  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.119071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 277 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  26.25 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 325 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0230  DNA-binding protein  29.87 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0592162  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 220 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 409 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0249  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 213 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  30.43 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  28.43 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1389  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  25 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  34.18 
 
 		 234 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  32.39 
 
 		 256 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 140 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 118 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 219 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 195 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 86 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  33.75 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 114 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  34.18 
 
 		 410 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  32.79 
 
 		 200 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 211 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 211 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  31.58 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2118  Cro/CI family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 306 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2158  Cro/CI family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000179355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  28.12 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>