90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3256 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  262  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  45.45 
 
 		 210 aa  47.8  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 91 aa  47.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  45.45 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  36.11 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4157  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.555179  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  36.11 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 368 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  31.88 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  36.84 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  46.15 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  43.33 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 192 aa  43.9  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  30.59 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  39.66 
 
 		 465 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  37.74 
 
 		 369 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  44.44 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 358 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 513 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  40 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 84 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 361 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 161 aa  41.6  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  32.39 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 268 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  40.82 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  40.48 
 
 		 262 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  40.48 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 208 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0807  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 178 aa  40.8  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 221 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  38.33 
 
 		 221 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 321 aa  40.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  40.48 
 
 		 262 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 262 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  40 
 
 		 227 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 268 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  45.28 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 266 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3863  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  43.4 
 
 		 507 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.640494  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  43.75 
 
 		 293 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  32.73 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  41.82 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  39.22 
 
 		 200 aa  40  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 112 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 104 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 62 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>