114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0080 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0080  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0107251  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1358  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 286 aa  51.2  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000701954  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1530  XRE family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0128315  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0934  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 285 aa  48.9  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.173772  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 488 aa  48.5  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1490  MutR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 282 aa  48.1  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000229278  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  41.07 
 
 		 215 aa  47.8  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 76 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2064  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  38.46 
 
 		 299 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2158  Cro/CI family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000179355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  36.49 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2112  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  38.1 
 
 		 299 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2388  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  38.1 
 
 		 299 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  30.99 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  26.76 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  29.73 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 253 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  38.98 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  30.99 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 81 aa  44.7  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  31.91 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 106 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3773  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  31.4 
 
 		 294 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  30.3 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  30.3 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  30.3 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  30.3 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  30.3 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  30.3 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  30.3 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  33.87 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  38.18 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  41.07 
 
 		 232 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2538  transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 		 145 aa  43.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0200677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 208 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 91 aa  42  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 195 aa  42  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 118 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0657  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 98 aa  42  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0482  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 125 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0889934  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  28.74 
 
 		 305 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  26.05 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>