39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0482 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0482  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  253  8e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0889934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4609  transcriptional regulator  45.37 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.273253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4589  helix-turn-helix domain protein  45.37 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0851  transcriptional regulator  47.75 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36492e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4613  helix-turn-helix domain-containing protein  43.64 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4592  helix-turn-helix domain protein  43.64 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0847  hypothetical protein  49 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  49.09 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2601  putative transcriptional regulator  45.76 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0680466  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  32.23 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  36.17 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1318  transcriptional regulator, XRE family  59.46 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3114  XRE family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 503 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1891  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  40.68 
 
 		 323 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 256 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  43.75 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 253 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  43.75 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4657  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.04 
 
 		 305 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0877  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.04 
 
 		 317 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 300 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 259 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0080  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 195 aa  42  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0107251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 414 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  43.55 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6641  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  28.77 
 
 		 342 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5157  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086798  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  26.03 
 
 		 402 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 199 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0828  XRE family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 282 aa  40  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>