110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1900 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1900  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 104 aa  204  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.43236e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1462  transcriptional regulator, XRE family  34.91 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  50.98 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  29 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4440  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  43.1 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  43.1 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  44.23 
 
 		 216 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  43.1 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  43.1 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  43.1 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  43.1 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 208 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5312  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  43.1 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 207 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1422  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 652 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 470 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 470 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  32.86 
 
 		 235 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  32.18 
 
 		 483 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  29.47 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 349 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  27.84 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1297  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  34.09 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 461 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  34.41 
 
 		 461 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  37.18 
 
 		 461 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 200 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0063  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2181  Cro/CI family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3556  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1788  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0750  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 252 aa  40.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 212 aa  40.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 		 199 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.38 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  28.38 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  28.38 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  28.38 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 500 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  28.38 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>