58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1190 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1190  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 126 aa  255  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815543  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  31.73 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 189 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  41.79 
 
 		 189 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  41.94 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  39.68 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  40.32 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  40.98 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 259 aa  47.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  38.71 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  36.49 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  36.11 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  36.49 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  36.11 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  36.11 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3926  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  32.04 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  33.33 
 
 		 245 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  39.13 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 229 aa  43.9  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  33.85 
 
 		 240 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 359 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 374 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 		 205 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0433  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 215 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 206 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  36.92 
 
 		 205 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3951  helix-turn-helix domain protein  30.77 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  38.33 
 
 		 436 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 321 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  33.85 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  33.85 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  34.25 
 
 		 283 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 197 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  36.67 
 
 		 200 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 364 aa  40.4  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  30.56 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1213  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 394 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00829806  decreased coverage  0.0000499416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>