36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0878 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0878  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2624  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00551798  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  35.71 
 
 		 386 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  40.24 
 
 		 414 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  27.88 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2624  putative prophage repressor  39.22 
 
 		 205 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879021  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1519  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0937641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 81 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2733  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0501  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 163 aa  40.8  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 393 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 346 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 505 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 488 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  43.9 
 
 		 355 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2104  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.946705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4276  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.204004  normal  0.368569 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08300  Helix-turn-helix protein  44.44 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0532 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0059  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 		 359 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2419  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.75 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 242 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  38.89 
 
 		 342 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 104 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>