25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1203 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1203  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 69 aa  139  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.48575 
 
 
-
 
NC_002950  PG0543  transcriptional regulator, putative  53.62 
 
 		 67 aa  79  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2560  transcriptional regulator, XRE family  54.24 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2935  hypothetical protein  50.85 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.111213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4109  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0516586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4372  helix-turn-helix domain-containing protein  40.68 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0153789  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1362  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120479 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  34.85 
 
 		 476 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.23 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4276  transcriptional regulator, XRE family  29.31 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.204004  normal  0.368569 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2104  transcriptional regulator, XRE family  29.31 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.946705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  35.48 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 482 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1903  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.282612  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  33.33 
 
 		 203 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 110 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 281 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 199 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 483 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 483 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 480 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  31.75 
 
 		 68 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 165 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>