22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0910 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0910  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 
130 aa  260  4e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0863  transcriptional regulator, XRE family  80 
 
 
130 aa  209  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  39.06 
 
 
238 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  39.06 
 
 
238 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  31.31 
 
 
217 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  31.31 
 
 
217 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  31.31 
 
 
217 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  31.31 
 
 
217 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0411  transcriptional regulator  30.43 
 
 
217 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0476  DNA-binding protein  30.43 
 
 
217 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0422  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 
217 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2624  putative prophage repressor  40.62 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4824  DNA-binding protein  29.35 
 
 
217 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0158337  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0468  DNA-binding protein  29.35 
 
 
217 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0494  DNA-binding protein  29.35 
 
 
217 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  32.14 
 
 
401 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0413  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 
217 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  33.87 
 
 
270 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  35.71 
 
 
233 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  35.71 
 
 
233 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  33.33 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 
204 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>