108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1331 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 401 aa  800    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  39.18 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  33.73 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  28.07 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  32.87 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  32.81 
 
 		 355 aa  126  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  31.5 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  31.74 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  30.03 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  29.18 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  30.18 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  29.43 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  28.49 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  29.76 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  28.57 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  29.17 
 
 		 367 aa  110  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  26.14 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  30.31 
 
 		 360 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  28.26 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  29.95 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  30.91 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  28.75 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  28.66 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  30.03 
 
 		 342 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  30.22 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  23.95 
 
 		 391 aa  103  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  23.95 
 
 		 391 aa  103  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  26.55 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  28.53 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  27.09 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  27.76 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  27.79 
 
 		 352 aa  97.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  27.07 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  30.18 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  24.19 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  29.81 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  29.24 
 
 		 357 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  30.74 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  30.74 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  30.74 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  28.97 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  27.38 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  30.28 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  32.09 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  28.06 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  29.37 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  25 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  30.06 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  24.09 
 
 		 355 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  25.4 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  28.05 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  34.17 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  31.32 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  22.83 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  27.11 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  21.14 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  39.06 
 
 		 233 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  39.06 
 
 		 233 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  39.06 
 
 		 233 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  30.3 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  30.3 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  30.3 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 396 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5468  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 174 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.624713 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 133 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2518  protein of unknown function DUF955  21.22 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.010681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  41.38 
 
 		 173 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  29.85 
 
 		 291 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  28.15 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 359 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  29.8 
 
 		 289 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  26.78 
 
 		 257 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1728  protein of unknown function DUF955  36.71 
 
 		 331 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  25.17 
 
 		 294 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  39.02 
 
 		 169 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  26.89 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  34.31 
 
 		 257 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 		 255 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  32.86 
 
 		 144 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  25.78 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  32.14 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0910  helix-turn-helix domain protein  32.14 
 
 		 130 aa  46.2  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  29.37 
 
 		 186 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2624  putative prophage repressor  31.33 
 
 		 205 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879021  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  31.82 
 
 		 182 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  31.25 
 
 		 147 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 135 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0034  zinc-related peptidase  25.32 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000203877  decreased coverage  0.0000849316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  25.8 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 117 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0915  hypothetical protein  26.85 
 
 		 341 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.938831  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  40.38 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 256 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 217 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 217 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 217 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0863  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 130 aa  43.5  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  34.15 
 
 		 95 aa  43.5  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 217 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>