20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0863 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0863  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 130 aa  258  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0910  helix-turn-helix domain protein  80 
 
 		 130 aa  209  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  32.08 
 
 		 217 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 217 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  32.08 
 
 		 217 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  32.08 
 
 		 217 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  35.38 
 
 		 238 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  35.38 
 
 		 238 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0422  helix-turn-helix domain-containing protein  38.6 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0411  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 217 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0476  DNA-binding protein  29.55 
 
 		 217 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4824  DNA-binding protein  28.41 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0158337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0413  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0468  DNA-binding protein  28.41 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0494  DNA-binding protein  28.41 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144904  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  33.87 
 
 		 270 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  32.14 
 
 		 401 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2624  putative prophage repressor  35.94 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879021  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 229 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1851  transcriptional regulator, XRE family  28.05 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>