51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B4824 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B4824  DNA-binding protein  100 
 
 
217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0158337  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  93.55 
 
 
217 aa  421  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  93.09 
 
 
217 aa  420  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  93.09 
 
 
217 aa  421  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  93.09 
 
 
217 aa  421  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0468  DNA-binding protein  93.09 
 
 
217 aa  400  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0411  transcriptional regulator  93.09 
 
 
217 aa  400  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0476  DNA-binding protein  93.09 
 
 
217 aa  400  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0494  DNA-binding protein  93.09 
 
 
217 aa  400  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0413  XRE family transcriptional regulator  88.48 
 
 
217 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0422  helix-turn-helix domain-containing protein  75.46 
 
 
217 aa  347  7e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1268  helix-turn-helix domain-containing protein  47.64 
 
 
213 aa  184  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1805  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 
224 aa  148  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2192  transcriptional regulator, XRE family  40.5 
 
 
218 aa  148  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.426149  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0910  helix-turn-helix domain protein  30.3 
 
 
130 aa  52.4  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  37.04 
 
 
120 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0863  transcriptional regulator, XRE family  29.47 
 
 
130 aa  49.7  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  39.29 
 
 
131 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  38 
 
 
124 aa  48.9  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  30.3 
 
 
126 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  28.05 
 
 
139 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  33.77 
 
 
142 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  30.38 
 
 
124 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  34.34 
 
 
135 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  30.12 
 
 
129 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0208  hypothetical protein  31.34 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.776323  normal  0.198508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  35.48 
 
 
124 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  31.63 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  40 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  31.58 
 
 
127 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  31.58 
 
 
127 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  31.63 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  31.63 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  31.63 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  43.48 
 
 
182 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 
201 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
201 aa  42.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0643  hypothetical protein  38.36 
 
 
191 aa  42.4  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  42  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 
106 aa  42  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  34.55 
 
 
401 aa  41.6  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1649  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 
80 aa  41.6  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
285 aa  41.6  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  31.25 
 
 
181 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 
206 aa  41.6  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 
181 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>