24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1954 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1954  Phage repressor protein  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0691  hypothetical protein  43.58 
 
 		 215 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00140732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0751  hypothetical protein  43.58 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  40.25 
 
 		 230 aa  95.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4241  hypothetical protein  35.85 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  29.8 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  39.33 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  31.61 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  28.16 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  31.79 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  43.66 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  28.75 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  26.74 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  25.43 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  26.94 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  23.56 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  26 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  26 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  26 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  25 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  31.76 
 
 		 249 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 93 aa  41.6  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  27.27 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>