85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5099 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3187  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5099  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5180  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0203095 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2782  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  77.36 
 
 		 106 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.821719  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0095  XRE family transcriptional regulator  54 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5157  XRE family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 107 aa  96.7  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086798  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2204  XRE family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000000112019  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  45 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0551  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3236  transcriptional regulator, XRE family  44.05 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 192 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 192 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 192 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 193 aa  52.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 190 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  39.74 
 
 		 236 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  39.74 
 
 		 236 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  39.74 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  39.74 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  39.74 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  39.74 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  39.74 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  39.74 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 189 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 192 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 191 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  41.25 
 
 		 281 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  40.79 
 
 		 199 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 197 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 199 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 199 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 199 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  38.81 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  32.29 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  38.89 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  32.29 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  32.29 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  42.19 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  42.19 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  42.19 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  45.31 
 
 		 488 aa  42.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  32.08 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 199 aa  42  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  38.54 
 
 		 370 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 322 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6541  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 118 aa  42  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 128 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 181 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 204 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0218  transciptional regulator  40.79 
 
 		 508 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  39.71 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  35.38 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05910  predicted transcriptional regulator  38.71 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.848221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1676  gp68  40 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 256 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4271  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4410  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>